Intellectuel autant que collectionneur, Martin Bodmer a accordé une importance essentielle à la recherche. Publiant dès 1954 le texte de l’Iliade d’Homère contenu sur le premier papyrus qu’il avait acquis, il a donné accès aux documents de sa collection afin de faciliter le travail des chercheurs.
Poursuivant cette tradition, la Fondation Martin Bodmer accueille annuellement une quarantaine de chercheurs pour la consultation et répond à une centaine de demandes de renseignements ou de reproductions.
Ces travaux débouchent souvent sur des publications scientifiques indépendantes. La Fondation Martin Bodmer encourage également la recherche par sa politique éditoriale propre tant dans la présentation des fac-similés de sa collection Sources que par ses monographies éditées chez Schwabe Verlag à Bâle et par les catalogues de son fonds.
Des cycles de conférences ou colloques universitaires ont régulièrement lieu à la Salle Historique.
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